Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRXP46100 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRXP46100 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRXP46100 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRXP46100 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRXP46100 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRXP46100 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRXP46100 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRXP46100 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRXP46100 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRXP46100 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRXP46100 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRXP46100 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRXP46100 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRXP46100 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRXP46100 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRXP46100 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRXP46100 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRXP46100 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRXP46100 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRXP46100 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRXP46100 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRXP46100 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRXP46100 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRXP46100 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRXP46100 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRXP46100 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRXP46100 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRXP46100 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATRXP46100 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATRXP46100 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRXP46100 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRXP46100 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRXP46100 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRXP46100 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRXP46100 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRXP46100 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRXP46100 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRXP46100 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRXP46100 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRXP46100 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRXP46100 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRXP46100 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRXP46100 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRXP46100 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRXP46100 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRXP46100 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRXP46100 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRXP46100 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRXP46100 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRXP46100 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRXP46100 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRXP46100 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRXP46100 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRXP46100 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRXP46100 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRXP46100 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRXP46100 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRXP46100 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRXP46100 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRXP46100 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRXP46100 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRXP46100 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRXP46100 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRXP46100 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRXP46100 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRXP46100 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRXP46100 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRXP46100 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRXP46100 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATRXP46100 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRXP46100 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATRXP46100 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATRXP46100 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRXP46100 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRXP46100 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRXP46100 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRXP46100 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRXP46100 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRXP46100 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRXP46100 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRXP46100 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRXP46100 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRXP46100 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRXP46100 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRXP46100 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRXP46100 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRXP46100 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRXP46100 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRXP46100 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRXP46100 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRXP46100 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRXP46100 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRXP46100 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRXP46100 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRXP46100 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRXP46100 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRXP46100 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRXP46100 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRXP46100 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms