Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A2P43354 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A2P43354 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms