Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PI4KAP42356 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PI4KAP42356 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PI4KAP42356 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PI4KAP42356 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PI4KAP42356 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms