Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5CP41229 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
KDM5CP41229 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
KDM5CP41229 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KDM5CP41229 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5CP41229 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms