Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNCAP37840 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCAP37840 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCAP37840 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCAP37840 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCAP37840 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCAP37840 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCAP37840 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCAP37840 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCAP37840 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCAP37840 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCAP37840 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCAP37840 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCAP37840 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCAP37840 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCAP37840 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCAP37840 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCAP37840 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCAP37840 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCAP37840 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCAP37840 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCAP37840 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCAP37840 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCAP37840 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCAP37840 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCAP37840 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCAP37840 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCAP37840 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCAP37840 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCAP37840 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCAP37840 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCAP37840 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCAP37840 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCAP37840 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCAP37840 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCAP37840 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCAP37840 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCAP37840 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCAP37840 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCAP37840 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCAP37840 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCAP37840 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCAP37840 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCAP37840 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCAP37840 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCAP37840 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCAP37840 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCAP37840 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCAP37840 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCAP37840 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNCAP37840 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCAP37840 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNCAP37840 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCAP37840 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCAP37840 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCAP37840 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCAP37840 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNCAP37840 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCAP37840 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCAP37840 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNCAP37840 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCAP37840 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCAP37840 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCAP37840 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCAP37840 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCAP37840 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCAP37840 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCAP37840 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCAP37840 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCAP37840 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCAP37840 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNCAP37840 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNCAP37840 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNCAP37840 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNCAP37840 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNCAP37840 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNCAP37840 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNCAP37840 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNCAP37840 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNCAP37840 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SNCAP37840 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCAP37840 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNCAP37840 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNCAP37840 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNCAP37840 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNCAP37840 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNCAP37840 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNCAP37840 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNCAP37840 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCAP37840 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCAP37840 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCAP37840 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCAP37840 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCAP37840 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCAP37840 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCAP37840 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCAP37840 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCAP37840 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNCAP37840 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNCAP37840 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms