Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TGFBR1P36897 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGFBR1P36897 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms