Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN2P35609 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN2P35609 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN2P35609 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms