Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GTF2H1P32780 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2H1P32780 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2H1P32780 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2H1P32780 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms