Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXA13P31271 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXA13P31271 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXA13P31271 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA13P31271 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA13P31271 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HOXA13P31271 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA13P31271 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms