Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTGFP29279 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTGFP29279 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTGFP29279 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTGFP29279 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTGFP29279 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTGFP29279 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTGFP29279 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CTGFP29279 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTGFP29279 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTGFP29279 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTGFP29279 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTGFP29279 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTGFP29279 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTGFP29279 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTGFP29279 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTGFP29279 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTGFP29279 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTGFP29279 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTGFP29279 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTGFP29279 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTGFP29279 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTGFP29279 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTGFP29279 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTGFP29279 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTGFP29279 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTGFP29279 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTGFP29279 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTGFP29279 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTGFP29279 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CTGFP29279 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CTGFP29279 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTGFP29279 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTGFP29279 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTGFP29279 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTGFP29279 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTGFP29279 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTGFP29279 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTGFP29279 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTGFP29279 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTGFP29279 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CTGFP29279 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTGFP29279 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTGFP29279 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTGFP29279 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTGFP29279 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTGFP29279 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTGFP29279 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTGFP29279 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTGFP29279 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTGFP29279 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTGFP29279 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CTGFP29279 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTGFP29279 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTGFP29279 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTGFP29279 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTGFP29279 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTGFP29279 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTGFP29279 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTGFP29279 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTGFP29279 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTGFP29279 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTGFP29279 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTGFP29279 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CTGFP29279 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTGFP29279 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTGFP29279 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTGFP29279 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTGFP29279 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CTGFP29279 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTGFP29279 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTGFP29279 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CTGFP29279 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTGFP29279 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTGFP29279 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTGFP29279 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTGFP29279 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTGFP29279 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTGFP29279 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTGFP29279 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTGFP29279 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTGFP29279 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTGFP29279 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTGFP29279 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTGFP29279 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTGFP29279 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTGFP29279 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTGFP29279 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTGFP29279 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTGFP29279 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTGFP29279 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTGFP29279 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTGFP29279 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CTGFP29279 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTGFP29279 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTGFP29279 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTGFP29279 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTGFP29279 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTGFP29279 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTGFP29279 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms