Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD3P28288 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD3P28288 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD3P28288 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms