Protein–RNA interactions for Protein: P27816

MAP4, Microtubule-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4P27816 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP4P27816 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP4P27816 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP4P27816 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP4P27816 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP4P27816 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP4P27816 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP4P27816 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP4P27816 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP4P27816 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP4P27816 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP4P27816 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP4P27816 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP4P27816 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP4P27816 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP4P27816 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP4P27816 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP4P27816 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP4P27816 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP4P27816 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP4P27816 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP4P27816 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP4P27816 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP4P27816 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP4P27816 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP4P27816 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP4P27816 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP4P27816 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP4P27816 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP4P27816 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP4P27816 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP4P27816 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP4P27816 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP4P27816 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP4P27816 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP4P27816 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP4P27816 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP4P27816 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP4P27816 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP4P27816 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP4P27816 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP4P27816 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP4P27816 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP4P27816 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP4P27816 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP4P27816 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP4P27816 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP4P27816 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP4P27816 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP4P27816 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP4P27816 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAP4P27816 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAP4P27816 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAP4P27816 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAP4P27816 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP4P27816 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP4P27816 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP4P27816 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP4P27816 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP4P27816 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP4P27816 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP4P27816 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP4P27816 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP4P27816 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP4P27816 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP4P27816 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP4P27816 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP4P27816 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP4P27816 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP4P27816 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP4P27816 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP4P27816 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP4P27816 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP4P27816 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP4P27816 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP4P27816 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP4P27816 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP4P27816 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP4P27816 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP4P27816 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP4P27816 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP4P27816 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP4P27816 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP4P27816 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP4P27816 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP4P27816 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP4P27816 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP4P27816 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP4P27816 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP4P27816 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP4P27816 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP4P27816 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP4P27816 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP4P27816 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP4P27816 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP4P27816 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP4P27816 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP4P27816 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP4P27816 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP4P27816 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms