Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPREP23469 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPREP23469 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPREP23469 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPREP23469 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPREP23469 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPREP23469 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPREP23469 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPREP23469 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPREP23469 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPREP23469 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPREP23469 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPREP23469 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPREP23469 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPREP23469 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPREP23469 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPREP23469 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPREP23469 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPREP23469 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PTPREP23469 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPREP23469 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPREP23469 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPREP23469 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPREP23469 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPREP23469 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPREP23469 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPREP23469 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPREP23469 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPREP23469 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPREP23469 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPREP23469 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPREP23469 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPREP23469 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPREP23469 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPREP23469 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPREP23469 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPREP23469 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPREP23469 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPREP23469 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPREP23469 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPREP23469 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPREP23469 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPREP23469 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPREP23469 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPREP23469 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPREP23469 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPREP23469 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPREP23469 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPREP23469 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPREP23469 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPREP23469 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPREP23469 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPREP23469 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPREP23469 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPREP23469 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPREP23469 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPREP23469 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPREP23469 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPREP23469 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPREP23469 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPREP23469 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPREP23469 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPREP23469 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPREP23469 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPREP23469 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPREP23469 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPREP23469 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPREP23469 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPREP23469 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPREP23469 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPREP23469 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPREP23469 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPREP23469 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPREP23469 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPREP23469 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPREP23469 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPREP23469 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPREP23469 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPREP23469 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPREP23469 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPREP23469 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPREP23469 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPREP23469 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPREP23469 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPREP23469 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPREP23469 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PTPREP23469 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPREP23469 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPREP23469 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPREP23469 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPREP23469 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPREP23469 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPREP23469 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPREP23469 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPREP23469 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPREP23469 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPREP23469 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPREP23469 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPREP23469 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPREP23469 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms