Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BCKDHBP21953 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCKDHBP21953 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCKDHBP21953 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCKDHBP21953 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCKDHBP21953 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCKDHBP21953 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCKDHBP21953 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCKDHBP21953 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BCKDHBP21953 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCKDHBP21953 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BCKDHBP21953 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCKDHBP21953 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCKDHBP21953 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCKDHBP21953 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms