Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ERBB3P21860 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ERBB3P21860 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ERBB3P21860 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ERBB3P21860 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERBB3P21860 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms