Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB8P17481 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB8P17481 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXB8P17481 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB8P17481 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms