Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCANP13611 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
VCANP13611 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCANP13611 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCANP13611 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCANP13611 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCANP13611 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCANP13611 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCANP13611 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCANP13611 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCANP13611 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCANP13611 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCANP13611 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCANP13611 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCANP13611 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCANP13611 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCANP13611 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCANP13611 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCANP13611 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCANP13611 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
VCANP13611 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCANP13611 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCANP13611 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCANP13611 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCANP13611 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCANP13611 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCANP13611 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCANP13611 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCANP13611 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VCANP13611 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCANP13611 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VCANP13611 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCANP13611 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCANP13611 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCANP13611 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VCANP13611 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCANP13611 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCANP13611 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCANP13611 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCANP13611 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VCANP13611 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCANP13611 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCANP13611 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCANP13611 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCANP13611 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VCANP13611 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCANP13611 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCANP13611 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCANP13611 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCANP13611 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCANP13611 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCANP13611 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCANP13611 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCANP13611 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCANP13611 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCANP13611 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCANP13611 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCANP13611 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCANP13611 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCANP13611 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCANP13611 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCANP13611 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VCANP13611 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VCANP13611 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VCANP13611 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VCANP13611 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCANP13611 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VCANP13611 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCANP13611 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VCANP13611 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VCANP13611 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCANP13611 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCANP13611 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCANP13611 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCANP13611 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCANP13611 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCANP13611 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCANP13611 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VCANP13611 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCANP13611 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCANP13611 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCANP13611 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCANP13611 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCANP13611 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCANP13611 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCANP13611 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCANP13611 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCANP13611 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCANP13611 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCANP13611 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCANP13611 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCANP13611 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCANP13611 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VCANP13611 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCANP13611 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCANP13611 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCANP13611 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCANP13611 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCANP13611 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCANP13611 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms