Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HARSP12081 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HARSP12081 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HARSP12081 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HARSP12081 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HARSP12081 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HARSP12081 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HARSP12081 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HARSP12081 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HARSP12081 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HARSP12081 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HARSP12081 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HARSP12081 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HARSP12081 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HARSP12081 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HARSP12081 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HARSP12081 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HARSP12081 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HARSP12081 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HARSP12081 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HARSP12081 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HARSP12081 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HARSP12081 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HARSP12081 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HARSP12081 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HARSP12081 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HARSP12081 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HARSP12081 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HARSP12081 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HARSP12081 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HARSP12081 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HARSP12081 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HARSP12081 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HARSP12081 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HARSP12081 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HARSP12081 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HARSP12081 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HARSP12081 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HARSP12081 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HARSP12081 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HARSP12081 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HARSP12081 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HARSP12081 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HARSP12081 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HARSP12081 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HARSP12081 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HARSP12081 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HARSP12081 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HARSP12081 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HARSP12081 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HARSP12081 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HARSP12081 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HARSP12081 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HARSP12081 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HARSP12081 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HARSP12081 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HARSP12081 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HARSP12081 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HARSP12081 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HARSP12081 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HARSP12081 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HARSP12081 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HARSP12081 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HARSP12081 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HARSP12081 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HARSP12081 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HARSP12081 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HARSP12081 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HARSP12081 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HARSP12081 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HARSP12081 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HARSP12081 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HARSP12081 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HARSP12081 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HARSP12081 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HARSP12081 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HARSP12081 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HARSP12081 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HARSP12081 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HARSP12081 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HARSP12081 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HARSP12081 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HARSP12081 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HARSP12081 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HARSP12081 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HARSP12081 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HARSP12081 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HARSP12081 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HARSP12081 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HARSP12081 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HARSP12081 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HARSP12081 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HARSP12081 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HARSP12081 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HARSP12081 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HARSP12081 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HARSP12081 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HARSP12081 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HARSP12081 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HARSP12081 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms