Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
LAMC1P11047 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
LAMC1P11047 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LAMC1P11047 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LAMC1P11047 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
LAMC1P11047 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms