Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TGFB3P10600 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TGFB3P10600 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TGFB3P10600 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TGFB3P10600 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TGFB3P10600 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms