Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT19P08727 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT19P08727 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT19P08727 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT19P08727 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT19P08727 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT19P08727 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT19P08727 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT19P08727 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT19P08727 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT19P08727 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT19P08727 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT19P08727 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT19P08727 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT19P08727 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT19P08727 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT19P08727 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT19P08727 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT19P08727 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT19P08727 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT19P08727 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT19P08727 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT19P08727 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT19P08727 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT19P08727 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT19P08727 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT19P08727 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT19P08727 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT19P08727 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT19P08727 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT19P08727 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT19P08727 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT19P08727 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT19P08727 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT19P08727 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT19P08727 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT19P08727 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT19P08727 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT19P08727 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT19P08727 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT19P08727 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT19P08727 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT19P08727 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT19P08727 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT19P08727 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT19P08727 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT19P08727 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT19P08727 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT19P08727 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT19P08727 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT19P08727 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT19P08727 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT19P08727 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT19P08727 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT19P08727 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT19P08727 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT19P08727 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT19P08727 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT19P08727 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT19P08727 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT19P08727 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT19P08727 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT19P08727 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT19P08727 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT19P08727 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT19P08727 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT19P08727 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT19P08727 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT19P08727 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT19P08727 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT19P08727 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT19P08727 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT19P08727 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT19P08727 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT19P08727 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT19P08727 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT19P08727 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT19P08727 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT19P08727 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT19P08727 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT19P08727 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT19P08727 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT19P08727 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT19P08727 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT19P08727 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT19P08727 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT19P08727 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT19P08727 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT19P08727 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT19P08727 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT19P08727 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT19P08727 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT19P08727 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT19P08727 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT19P08727 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT19P08727 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT19P08727 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT19P08727 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT19P08727 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT19P08727 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms