Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPLP06858 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPLP06858 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPLP06858 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPLP06858 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPLP06858 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPLP06858 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LPLP06858 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LPLP06858 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPLP06858 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPLP06858 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LPLP06858 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LPLP06858 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPLP06858 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPLP06858 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LPLP06858 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPLP06858 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPLP06858 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPLP06858 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPLP06858 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPLP06858 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPLP06858 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPLP06858 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LPLP06858 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPLP06858 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPLP06858 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPLP06858 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPLP06858 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LPLP06858 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPLP06858 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPLP06858 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LPLP06858 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LPLP06858 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPLP06858 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPLP06858 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPLP06858 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPLP06858 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LPLP06858 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LPLP06858 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPLP06858 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPLP06858 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPLP06858 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPLP06858 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPLP06858 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LPLP06858 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LPLP06858 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPLP06858 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPLP06858 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPLP06858 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPLP06858 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LPLP06858 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPLP06858 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPLP06858 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPLP06858 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LPLP06858 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPLP06858 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPLP06858 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPLP06858 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPLP06858 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPLP06858 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPLP06858 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPLP06858 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LPLP06858 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPLP06858 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPLP06858 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LPLP06858 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPLP06858 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPLP06858 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPLP06858 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPLP06858 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPLP06858 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LPLP06858 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPLP06858 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPLP06858 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPLP06858 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LPLP06858 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPLP06858 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPLP06858 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPLP06858 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPLP06858 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPLP06858 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LPLP06858 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LPLP06858 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LPLP06858 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LPLP06858 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LPLP06858 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LPLP06858 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LPLP06858 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LPLP06858 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LPLP06858 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LPLP06858 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LPLP06858 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LPLP06858 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LPLP06858 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LPLP06858 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LPLP06858 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LPLP06858 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LPLP06858 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LPLP06858 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LPLP06858 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms