Protein–RNA interactions for Protein: P06730

EIF4E, Eukaryotic translation initiation factor 4E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EP06730 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4EP06730 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF4EP06730 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EIF4EP06730 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.33■■□□□ 1
EIF4EP06730 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EIF4EP06730 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF4EP06730 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF4EP06730 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF4EP06730 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF4EP06730 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF4EP06730 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF4EP06730 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF4EP06730 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EIF4EP06730 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF4EP06730 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF4EP06730 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF4EP06730 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF4EP06730 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF4EP06730 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF4EP06730 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF4EP06730 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF4EP06730 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF4EP06730 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF4EP06730 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4EP06730 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4EP06730 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4EP06730 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EIF4EP06730 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4EP06730 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4EP06730 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EIF4EP06730 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EIF4EP06730 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4EP06730 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4EP06730 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4EP06730 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4EP06730 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4EP06730 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4EP06730 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4EP06730 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4EP06730 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4EP06730 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4EP06730 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4EP06730 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4EP06730 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4EP06730 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4EP06730 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms