Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPIND1P05546 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SERPIND1P05546 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms