Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDN1P05305 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDN1P05305 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDN1P05305 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
EDN1P05305 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDN1P05305 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDN1P05305 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDN1P05305 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDN1P05305 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDN1P05305 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDN1P05305 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDN1P05305 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDN1P05305 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDN1P05305 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
EDN1P05305 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDN1P05305 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDN1P05305 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDN1P05305 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDN1P05305 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDN1P05305 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDN1P05305 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDN1P05305 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDN1P05305 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDN1P05305 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDN1P05305 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EDN1P05305 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDN1P05305 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDN1P05305 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EDN1P05305 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDN1P05305 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDN1P05305 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDN1P05305 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDN1P05305 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDN1P05305 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDN1P05305 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDN1P05305 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDN1P05305 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDN1P05305 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EDN1P05305 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDN1P05305 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDN1P05305 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDN1P05305 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDN1P05305 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDN1P05305 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDN1P05305 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDN1P05305 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDN1P05305 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDN1P05305 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDN1P05305 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDN1P05305 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EDN1P05305 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
EDN1P05305 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDN1P05305 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EDN1P05305 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDN1P05305 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDN1P05305 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDN1P05305 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDN1P05305 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDN1P05305 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDN1P05305 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDN1P05305 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDN1P05305 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDN1P05305 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDN1P05305 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EDN1P05305 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDN1P05305 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDN1P05305 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EDN1P05305 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDN1P05305 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDN1P05305 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDN1P05305 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDN1P05305 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDN1P05305 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDN1P05305 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDN1P05305 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDN1P05305 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDN1P05305 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDN1P05305 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDN1P05305 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EDN1P05305 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EDN1P05305 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EDN1P05305 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EDN1P05305 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EDN1P05305 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDN1P05305 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EDN1P05305 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDN1P05305 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EDN1P05305 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDN1P05305 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDN1P05305 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDN1P05305 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EDN1P05305 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDN1P05305 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDN1P05305 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDN1P05305 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDN1P05305 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDN1P05305 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDN1P05305 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDN1P05305 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDN1P05305 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms