Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTRK1P04629 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NTRK1P04629 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NTRK1P04629 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK1P04629 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms