Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLIC3O95833 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIC3O95833 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLIC3O95833 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms