Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBB3O95704 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBB3O95704 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APBB3O95704 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBB3O95704 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBB3O95704 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
APBB3O95704 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBB3O95704 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBB3O95704 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBB3O95704 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBB3O95704 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APBB3O95704 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
APBB3O95704 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APBB3O95704 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APBB3O95704 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APBB3O95704 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APBB3O95704 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
APBB3O95704 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
APBB3O95704 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APBB3O95704 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APBB3O95704 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APBB3O95704 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APBB3O95704 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APBB3O95704 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APBB3O95704 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBB3O95704 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBB3O95704 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBB3O95704 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APBB3O95704 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APBB3O95704 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APBB3O95704 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APBB3O95704 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APBB3O95704 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APBB3O95704 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APBB3O95704 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APBB3O95704 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APBB3O95704 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APBB3O95704 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBB3O95704 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APBB3O95704 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBB3O95704 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBB3O95704 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBB3O95704 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APBB3O95704 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBB3O95704 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBB3O95704 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBB3O95704 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APBB3O95704 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBB3O95704 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBB3O95704 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBB3O95704 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBB3O95704 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBB3O95704 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBB3O95704 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBB3O95704 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBB3O95704 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBB3O95704 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBB3O95704 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBB3O95704 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBB3O95704 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBB3O95704 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBB3O95704 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APBB3O95704 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBB3O95704 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBB3O95704 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APBB3O95704 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBB3O95704 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBB3O95704 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBB3O95704 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBB3O95704 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBB3O95704 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBB3O95704 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APBB3O95704 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APBB3O95704 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APBB3O95704 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APBB3O95704 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBB3O95704 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBB3O95704 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBB3O95704 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBB3O95704 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APBB3O95704 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBB3O95704 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBB3O95704 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APBB3O95704 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APBB3O95704 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APBB3O95704 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APBB3O95704 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APBB3O95704 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APBB3O95704 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APBB3O95704 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
APBB3O95704 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APBB3O95704 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APBB3O95704 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBB3O95704 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBB3O95704 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APBB3O95704 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBB3O95704 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBB3O95704 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBB3O95704 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APBB3O95704 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms