Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STAMBPO95630 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAMBPO95630 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAMBPO95630 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPO95630 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms