Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT34O76011 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT34O76011 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT34O76011 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT34O76011 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT34O76011 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT34O76011 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT34O76011 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT34O76011 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT34O76011 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT34O76011 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT34O76011 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT34O76011 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT34O76011 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT34O76011 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT34O76011 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT34O76011 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT34O76011 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT34O76011 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT34O76011 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT34O76011 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT34O76011 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT34O76011 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT34O76011 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT34O76011 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT34O76011 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT34O76011 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT34O76011 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT34O76011 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT34O76011 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT34O76011 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT34O76011 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT34O76011 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT34O76011 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT34O76011 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT34O76011 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT34O76011 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT34O76011 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT34O76011 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT34O76011 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT34O76011 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT34O76011 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT34O76011 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT34O76011 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT34O76011 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT34O76011 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT34O76011 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT34O76011 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT34O76011 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT34O76011 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT34O76011 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT34O76011 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT34O76011 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT34O76011 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT34O76011 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT34O76011 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT34O76011 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT34O76011 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT34O76011 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT34O76011 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT34O76011 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT34O76011 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT34O76011 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT34O76011 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT34O76011 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT34O76011 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT34O76011 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT34O76011 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT34O76011 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT34O76011 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT34O76011 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT34O76011 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT34O76011 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT34O76011 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT34O76011 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT34O76011 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT34O76011 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT34O76011 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT34O76011 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT34O76011 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT34O76011 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT34O76011 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT34O76011 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT34O76011 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT34O76011 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT34O76011 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT34O76011 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT34O76011 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT34O76011 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT34O76011 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT34O76011 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT34O76011 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT34O76011 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT34O76011 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT34O76011 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT34O76011 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT34O76011 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT34O76011 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT34O76011 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT34O76011 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms