Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCATO75600 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCATO75600 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCATO75600 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GCATO75600 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCATO75600 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCATO75600 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCATO75600 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCATO75600 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GCATO75600 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCATO75600 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCATO75600 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCATO75600 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCATO75600 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCATO75600 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCATO75600 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCATO75600 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCATO75600 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCATO75600 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCATO75600 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCATO75600 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCATO75600 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCATO75600 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCATO75600 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GCATO75600 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCATO75600 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCATO75600 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCATO75600 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCATO75600 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCATO75600 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCATO75600 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCATO75600 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCATO75600 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCATO75600 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCATO75600 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCATO75600 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCATO75600 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCATO75600 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCATO75600 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GCATO75600 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCATO75600 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCATO75600 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCATO75600 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCATO75600 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCATO75600 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCATO75600 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCATO75600 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCATO75600 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCATO75600 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCATO75600 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GCATO75600 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCATO75600 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCATO75600 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCATO75600 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCATO75600 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCATO75600 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCATO75600 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GCATO75600 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCATO75600 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCATO75600 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCATO75600 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCATO75600 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCATO75600 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCATO75600 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCATO75600 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCATO75600 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCATO75600 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCATO75600 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCATO75600 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCATO75600 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCATO75600 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCATO75600 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCATO75600 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCATO75600 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCATO75600 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCATO75600 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCATO75600 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCATO75600 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCATO75600 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCATO75600 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCATO75600 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCATO75600 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCATO75600 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCATO75600 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCATO75600 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCATO75600 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCATO75600 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCATO75600 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCATO75600 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCATO75600 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCATO75600 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCATO75600 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCATO75600 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCATO75600 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GCATO75600 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCATO75600 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCATO75600 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCATO75600 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCATO75600 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCATO75600 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms