Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKAP2O75563 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms