Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIN3BO75182 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3BO75182 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3BO75182 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms