Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KERAO60938 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KERAO60938 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KERAO60938 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KERAO60938 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KERAO60938 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KERAO60938 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KERAO60938 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KERAO60938 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KERAO60938 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KERAO60938 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KERAO60938 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KERAO60938 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KERAO60938 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KERAO60938 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KERAO60938 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KERAO60938 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KERAO60938 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KERAO60938 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KERAO60938 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KERAO60938 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KERAO60938 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KERAO60938 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KERAO60938 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KERAO60938 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KERAO60938 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KERAO60938 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KERAO60938 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KERAO60938 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KERAO60938 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KERAO60938 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KERAO60938 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KERAO60938 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KERAO60938 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KERAO60938 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KERAO60938 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KERAO60938 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KERAO60938 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KERAO60938 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KERAO60938 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KERAO60938 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KERAO60938 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms