Protein–RNA interactions for Protein: O60291

MGRN1, E3 ubiquitin-protein ligase MGRN1, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGRN1O60291 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MGRN1O60291 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MGRN1O60291 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGRN1O60291 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MGRN1O60291 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MGRN1O60291 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MGRN1O60291 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MGRN1O60291 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MGRN1O60291 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MGRN1O60291 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MGRN1O60291 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MGRN1O60291 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MGRN1O60291 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MGRN1O60291 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MGRN1O60291 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms