Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SPAG9O60271 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SPAG9O60271 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SPAG9O60271 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SPAG9O60271 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SPAG9O60271 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SPAG9O60271 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
SPAG9O60271 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
SPAG9O60271 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
SPAG9O60271 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SPAG9O60271 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SPAG9O60271 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
SPAG9O60271 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.5 ms