Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VEGFDO43915 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFDO43915 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFDO43915 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VEGFDO43915 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms