Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPOPO43791 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPOPO43791 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPOPO43791 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SPOPO43791 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPOPO43791 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPOPO43791 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPOPO43791 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPOPO43791 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPOPO43791 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPOPO43791 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPOPO43791 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPOPO43791 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPOPO43791 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPOPO43791 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPOPO43791 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPOPO43791 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPOPO43791 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPOPO43791 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPOPO43791 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPOPO43791 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPOPO43791 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPOPO43791 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPOPO43791 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPOPO43791 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPOPO43791 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPOPO43791 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPOPO43791 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPOPO43791 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPOPO43791 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPOPO43791 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPOPO43791 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPOPO43791 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPOPO43791 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOPO43791 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOPO43791 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOPO43791 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOPO43791 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOPO43791 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOPO43791 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOPO43791 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOPO43791 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOPO43791 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOPO43791 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOPO43791 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOPO43791 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPOPO43791 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPOPO43791 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPOPO43791 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SPOPO43791 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPOPO43791 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPOPO43791 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPOPO43791 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPOPO43791 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPOPO43791 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPOPO43791 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPOPO43791 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPOPO43791 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPOPO43791 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPOPO43791 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPOPO43791 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPOPO43791 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPOPO43791 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPOPO43791 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPOPO43791 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPOPO43791 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPOPO43791 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPOPO43791 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPOPO43791 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPOPO43791 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPOPO43791 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPOPO43791 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPOPO43791 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPOPO43791 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPOPO43791 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPOPO43791 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPOPO43791 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPOPO43791 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPOPO43791 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPOPO43791 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPOPO43791 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPOPO43791 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPOPO43791 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPOPO43791 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPOPO43791 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPOPO43791 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPOPO43791 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPOPO43791 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPOPO43791 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPOPO43791 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPOPO43791 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPOPO43791 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPOPO43791 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPOPO43791 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPOPO43791 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPOPO43791 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPOPO43791 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPOPO43791 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPOPO43791 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPOPO43791 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms