Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSI1O43347 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSI1O43347 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSI1O43347 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSI1O43347 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSI1O43347 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSI1O43347 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSI1O43347 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSI1O43347 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSI1O43347 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSI1O43347 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSI1O43347 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSI1O43347 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSI1O43347 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSI1O43347 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSI1O43347 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSI1O43347 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSI1O43347 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSI1O43347 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSI1O43347 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MSI1O43347 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSI1O43347 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSI1O43347 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSI1O43347 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MSI1O43347 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSI1O43347 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSI1O43347 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSI1O43347 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSI1O43347 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSI1O43347 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSI1O43347 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSI1O43347 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSI1O43347 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSI1O43347 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSI1O43347 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSI1O43347 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSI1O43347 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSI1O43347 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSI1O43347 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSI1O43347 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSI1O43347 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSI1O43347 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSI1O43347 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSI1O43347 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSI1O43347 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSI1O43347 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSI1O43347 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSI1O43347 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSI1O43347 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSI1O43347 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSI1O43347 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSI1O43347 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSI1O43347 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MSI1O43347 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSI1O43347 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSI1O43347 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSI1O43347 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSI1O43347 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSI1O43347 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSI1O43347 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSI1O43347 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSI1O43347 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MSI1O43347 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSI1O43347 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MSI1O43347 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSI1O43347 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSI1O43347 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSI1O43347 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSI1O43347 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MSI1O43347 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSI1O43347 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSI1O43347 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSI1O43347 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSI1O43347 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MSI1O43347 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MSI1O43347 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MSI1O43347 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MSI1O43347 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSI1O43347 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSI1O43347 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSI1O43347 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSI1O43347 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSI1O43347 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSI1O43347 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSI1O43347 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSI1O43347 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MSI1O43347 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSI1O43347 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSI1O43347 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSI1O43347 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSI1O43347 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSI1O43347 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSI1O43347 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSI1O43347 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSI1O43347 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSI1O43347 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSI1O43347 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSI1O43347 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSI1O43347 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSI1O43347 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms