Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
GPAA1O43292 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GPAA1O43292 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPAA1O43292 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPAA1O43292 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GPAA1O43292 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GPAA1O43292 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms