Protein–RNA interactions for Protein: O15484

CAPN5, Calpain-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN5O15484 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN5O15484 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN5O15484 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN5O15484 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN5O15484 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN5O15484 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN5O15484 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN5O15484 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN5O15484 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN5O15484 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN5O15484 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN5O15484 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN5O15484 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN5O15484 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN5O15484 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN5O15484 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms