Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF5O14894 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF5O14894 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF5O14894 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms