Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHOX2AO14813 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PHOX2AO14813 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms