Protein–RNA interactions for Protein: O14787

TNPO2, Transportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO2O14787 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNPO2O14787 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TNPO2O14787 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TNPO2O14787 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNPO2O14787 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO2O14787 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms