Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX7O00628 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX7O00628 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX7O00628 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX7O00628 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX7O00628 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PEX7O00628 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PEX7O00628 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PEX7O00628 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PEX7O00628 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PEX7O00628 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PEX7O00628 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PEX7O00628 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PEX7O00628 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX7O00628 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX7O00628 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX7O00628 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX7O00628 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX7O00628 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX7O00628 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX7O00628 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX7O00628 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX7O00628 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX7O00628 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX7O00628 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX7O00628 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX7O00628 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX7O00628 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX7O00628 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX7O00628 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX7O00628 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX7O00628 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX7O00628 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX7O00628 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX7O00628 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX7O00628 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX7O00628 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PEX7O00628 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX7O00628 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX7O00628 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX7O00628 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX7O00628 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX7O00628 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX7O00628 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX7O00628 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX7O00628 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX7O00628 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX7O00628 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX7O00628 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX7O00628 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX7O00628 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX7O00628 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX7O00628 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX7O00628 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX7O00628 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX7O00628 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX7O00628 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX7O00628 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX7O00628 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX7O00628 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX7O00628 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX7O00628 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX7O00628 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX7O00628 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX7O00628 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX7O00628 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX7O00628 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX7O00628 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX7O00628 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX7O00628 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX7O00628 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX7O00628 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX7O00628 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX7O00628 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX7O00628 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX7O00628 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX7O00628 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX7O00628 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX7O00628 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX7O00628 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX7O00628 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX7O00628 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX7O00628 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX7O00628 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX7O00628 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX7O00628 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX7O00628 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX7O00628 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX7O00628 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX7O00628 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX7O00628 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX7O00628 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX7O00628 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX7O00628 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX7O00628 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX7O00628 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX7O00628 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX7O00628 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX7O00628 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PEX7O00628 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms