Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MEIS1O00470 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEIS1O00470 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MEIS1O00470 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEIS1O00470 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS1O00470 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms