Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3C2AO00443 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3C2AO00443 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3C2AO00443 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIK3C2AO00443 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PIK3C2AO00443 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PIK3C2AO00443 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PIK3C2AO00443 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms