Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMIM22K7EJ46 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMIM22K7EJ46 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMIM22K7EJ46 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMIM22K7EJ46 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms