Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4E1Z4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4E1Z4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4E1Z4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4E1Z4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4E1Z4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4E1Z4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4E1Z4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
B4E1Z4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
B4E1Z4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
B4E1Z4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
B4E1Z4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
B4E1Z4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
B4E1Z4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
B4E1Z4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4E1Z4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4E1Z4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4E1Z4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4E1Z4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4E1Z4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
B4E1Z4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4E1Z4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
B4E1Z4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
B4E1Z4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
B4E1Z4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
B4E1Z4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
B4E1Z4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
B4E1Z4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
B4E1Z4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
B4E1Z4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
B4E1Z4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
B4E1Z4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
B4E1Z4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
B4E1Z4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
B4E1Z4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
B4E1Z4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
B4E1Z4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
B4E1Z4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
B4E1Z4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
B4E1Z4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
B4E1Z4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
B4E1Z4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
B4E1Z4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
B4E1Z4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
B4E1Z4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
B4E1Z4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
B4E1Z4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
B4E1Z4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
B4E1Z4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
B4E1Z4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
B4E1Z4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
B4E1Z4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
B4E1Z4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
B4E1Z4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
B4E1Z4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
B4E1Z4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
B4E1Z4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
B4E1Z4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
B4E1Z4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
B4E1Z4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
B4E1Z4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
B4E1Z4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
B4E1Z4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
B4E1Z4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
B4E1Z4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
B4E1Z4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
B4E1Z4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
B4E1Z4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
B4E1Z4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
B4E1Z4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
B4E1Z4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
B4E1Z4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
B4E1Z4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
B4E1Z4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
B4E1Z4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
B4E1Z4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
B4E1Z4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
B4E1Z4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
B4E1Z4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
B4E1Z4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
B4E1Z4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
B4E1Z4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
B4E1Z4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
B4E1Z4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
B4E1Z4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4E1Z4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4E1Z4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
B4E1Z4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4E1Z4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4E1Z4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4E1Z4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4E1Z4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
B4E1Z4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
B4E1Z4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
B4E1Z4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
B4E1Z4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4E1Z4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4E1Z4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4E1Z4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4E1Z4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms