Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB2A8KAH6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB2A8KAH6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB2A8KAH6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB2A8KAH6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB2A8KAH6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB2A8KAH6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB2A8KAH6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB2A8KAH6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB2A8KAH6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HSPB2A8KAH6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPB2A8KAH6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPB2A8KAH6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms